我國科研團(tuán)隊(duì)建成“數(shù)字家蠶”共享分析平臺
記者從西南大學(xué)資源昆蟲高效養(yǎng)殖與利用全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室獲悉,實(shí)驗(yàn)室代方銀教授團(tuán)隊(duì)取得最新科研成果——“數(shù)字家蠶”共享分析平臺,對于推動家蠶泛基因組成果在功能基因組、基因組選擇和分子設(shè)計(jì)育種等方面的研究應(yīng)用具有重要意義。相關(guān)研究成果近日在國際學(xué)術(shù)期刊《核酸研究》在線發(fā)表。
在現(xiàn)代蠶學(xué)研究和育種實(shí)踐中,泛基因組序列和多組學(xué)數(shù)據(jù)已經(jīng)成為科學(xué)家手中不可或缺的基礎(chǔ)資源,可以縮短研究和育種的時(shí)間,顯著提高工作效率。然而,多組學(xué)大數(shù)據(jù)的整合分析和使用具有成本高、技術(shù)難度大的特點(diǎn)。
代方銀介紹,分析平臺不僅涵蓋家蠶基因序列信息,還整合了家蠶基因表達(dá)、調(diào)控、功能研究等數(shù)據(jù),提供了開展比較基因組和功能基因組等方面研究的分析工具。
這是繼2022年該團(tuán)隊(duì)發(fā)布家蠶超級泛基因組圖譜后,推動創(chuàng)建“數(shù)字家蠶”取得的又一重大進(jìn)展。分析平臺整合了家蠶泛基因組序列及多組學(xué)數(shù)據(jù),將一個(gè)具有上千個(gè)種質(zhì)資源的線下實(shí)體基因資源庫轉(zhuǎn)化為組學(xué)序列數(shù)據(jù)庫并搬上互聯(lián)網(wǎng),實(shí)現(xiàn)種質(zhì)資源基因組、遺傳變異及表型等數(shù)據(jù)的開放共享和可視化分析。
“我們將它比喻為一部智能、高效的家蠶基因‘?dāng)?shù)字字典’或超級‘圖書館’,研究人員能在這里快速獲取家蠶基因組相關(guān)信息?!蔽髂洗髮W(xué)資源昆蟲高效養(yǎng)殖與利用全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室博士后陸昆鵬說。(記者周思宇)
版權(quán)聲明:凡注明“來源:中國西藏網(wǎng)”或“中國西藏網(wǎng)文”的所有作品,版權(quán)歸高原(北京)文化傳播有限公司。任何媒體轉(zhuǎn)載、摘編、引用,須注明來源中國西藏網(wǎng)和署著作者名,否則將追究相關(guān)法律責(zé)任。
- 神十六帶回的實(shí)驗(yàn)樣品在滬交付
- 40分鐘“打隧道”糾治出生22天嬰兒消化道畸形
- 前三季度全國新設(shè)民營企業(yè)706.5萬戶 發(fā)展韌性持續(xù)顯現(xiàn)
- 國內(nèi)首次摻氫天然氣管道燃爆試驗(yàn)成功
- 二○二三世界青年科學(xué)家峰會女科學(xué)家論壇舉辦
- 二〇二三世界劇院聯(lián)盟大會暨世界交響樂北京論壇開幕
- 專家:肺炎是5歲以下兒童的頭號殺手,建議加強(qiáng)疫苗接種
- 他們開始花錢了?
- 第六屆進(jìn)博會參展商負(fù)責(zé)人普遍表示——在中國市場收獲更多商機(jī)與信心
- 多種呼吸道疾病交織疊加!國家衛(wèi)健委:切忌亂用藥