中新網(wǎng)北京1月24日電 (記者 孫自法)施普林格·自然旗下學術期刊《自然-通訊》最新發(fā)表一篇遺傳學論文稱,研究人員報告了占全球咖啡產(chǎn)量約60%的阿拉比卡咖啡的改良基因組組裝,這項植物基因組研究發(fā)現(xiàn)揭示了咖啡遺傳多樣性的來源,可能促成了它獨特的風味與抗病性。
該論文介紹,商業(yè)咖啡主要由中果咖啡和小果咖啡組成,即所謂羅布斯塔咖啡和阿拉比卡咖啡。阿拉比卡咖啡是今日羅布斯塔咖啡的祖先和另一種近親咖啡物種雜交的產(chǎn)物。這一雜交帶來了阿拉比卡咖啡的風味和它巨大、復雜的基因組,造成培育和遺傳研究上的挑戰(zhàn)。目前已經(jīng)有了一些阿拉比卡咖啡的部分基因組組裝,但產(chǎn)生其遺傳多樣性的機制尚不明確。
本項研究中,論文共同通訊作者、意大利烏迪內(nèi)大學Michele Morgante和意大利應用遺傳學研究所Gabriele Di Gaspero與同事及合作者一起,通過使用最新測序技術,生成了阿拉比卡咖啡更完整的基因組組裝,使得人們能對其染色體結構進行詳細分析。
在分析包括此前無法獲得的基因組(如著絲粒周圍)時,論文作者發(fā)現(xiàn)了兩個祖先物種造成的基因組結構、功能和演化差異,特別是涉及咖啡因生物合成的基因。
他們還分析了174個樣本的基因組,收集自咖啡屬的不同物種,注意到在阿拉比卡咖啡中存在很低水平的遺傳多樣性。在一些阿拉比卡咖啡栽培品種的特定遺傳區(qū)域,多樣性有所增加,來自兩個不同變異源:染色體異常,和一種羅布斯塔-阿拉比卡雜交種(即“帝汶”混合種)來源的遺傳片段。這一雜交品種是許多現(xiàn)代栽培種的親本品系,結合了羅布斯塔咖啡的抗病性和阿拉比卡咖啡獨特的風味。
論文作者總結認為,阿拉比卡咖啡豆遺傳多樣性對其商業(yè)成功不可或缺,這項研究發(fā)現(xiàn)或有助于開發(fā)新的帶有人們所需特性的咖啡品種,例如抗病性或不同風味特征。(完)
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