肺腺癌分子全景首次繪出
我國科學(xué)家歷時6年時間,在國際上首次對肺腺癌開展大規(guī)模、高通量、系統(tǒng)性的全景蛋白質(zhì)組學(xué)研究,完成了臨床肺腺癌蛋白質(zhì)組草圖的繪制工作,相關(guān)研究論文7月9日發(fā)表在《細(xì)胞》雜志上。
蛋白質(zhì)是所有生命功能的直接執(zhí)行者,也幾乎是所有藥物的作用靶點。系統(tǒng)性研究細(xì)胞、組織等生物樣本中所有蛋白質(zhì)特征的學(xué)科,即蛋白質(zhì)組學(xué),已逐漸成為生物醫(yī)學(xué)研究的核心內(nèi)容之一。
因此,全景繪制肺腺癌人群蛋白質(zhì)分子圖譜,對于肺腺癌病理機(jī)制的深入認(rèn)識,疾病診斷生物標(biāo)志物與藥物治療靶點的發(fā)現(xiàn),以及實現(xiàn)更精準(zhǔn)的肺腺癌分子分型和治療方案的制訂等具有重大科學(xué)意義。
該研究由中科院上海藥物研究所譚敏佳研究員團(tuán)隊聯(lián)合軍事科學(xué)院軍事醫(yī)學(xué)研究院、國家蛋白質(zhì)科學(xué)中心(北京)賀福初院士團(tuán)隊、汪宜研究員團(tuán)隊,國家癌癥中心/中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤醫(yī)院程書鈞院士、肖汀研究員團(tuán)隊,上海交通大學(xué)李婧教授等團(tuán)隊合作完成。
在研究中,科研人員對103例臨床病人的肺腺癌和癌旁組織進(jìn)行了蛋白質(zhì)表達(dá)譜和磷酸化翻譯后修飾譜的深度解析,最終共鑒定11119個蛋白產(chǎn)物和22564個磷酸化修飾位點,同時整合臨床信息和基因組特征數(shù)據(jù)分析,深度構(gòu)建了基于蛋白質(zhì)組的肺腺癌分子圖譜全景。
研究不但首次從蛋白質(zhì)水平系統(tǒng)描繪了肺腺癌的分子圖譜,而且發(fā)現(xiàn)了與病人預(yù)后密切相關(guān)的分子特征,特別是發(fā)現(xiàn)了中國人群肺腺癌TP53和EGFR兩個主要基因突變?nèi)巳旱牡鞍踪|(zhì)分子特征。
另外,科研人員通過進(jìn)一步利用蛋白質(zhì)組表達(dá)譜數(shù)據(jù),將肺腺癌分為3個蛋白質(zhì)組亞型(Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型)。其中,Ⅰ型與細(xì)胞代謝和腫瘤微環(huán)境密切相關(guān),臨床信息顯示該型主要為臨床早期人群,預(yù)后最為良好;Ⅲ型與細(xì)胞穩(wěn)態(tài)及增殖密切相關(guān),其主要為臨床中后期人群,呈現(xiàn)出腫瘤分化程度較低,基因突變負(fù)荷較高等特征,預(yù)后最差;Ⅱ型則是Ⅰ型和Ⅲ型的過渡狀態(tài),這部分人群預(yù)后程度介于Ⅰ型和Ⅲ型之間。
在研究中,科研人員還篩選到27個具有血清學(xué)檢測價值的肺腺癌潛在預(yù)后標(biāo)志物及若干個針對肺腺癌以及其特定突變亞型的潛在藥物靶標(biāo)。通過對代表性標(biāo)志物HSP 90beta進(jìn)行較大規(guī)模的獨立人群的血漿樣本確證,發(fā)現(xiàn)其蛋白質(zhì)濃度與肺腺癌不良預(yù)后密切相關(guān)。
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