“海稻86”為何不怕咸? 測(cè)序技術(shù)鎖定水稻關(guān)鍵耐鹽基因
土壤中鹽的脅迫嚴(yán)重影響水稻的生長(zhǎng)發(fā)育,并降低其產(chǎn)量。因此,如何利用數(shù)量性狀基因座和連鎖標(biāo)記開(kāi)發(fā)耐鹽和高產(chǎn)水稻,是分子育種的關(guān)鍵選項(xiàng)。
近日,中科院西雙版納熱帶植物園熱帶稻種保護(hù)與遺傳改良研究組吳鋒玲等,成功定位到“海稻86”耐鹽相關(guān)基因。這一新的重要成果,對(duì)解析水稻耐鹽機(jī)理,以及我國(guó)新的優(yōu)質(zhì)耐鹽水稻品種的選育具有重要意義。
改善水稻的耐鹽性很重要
在全球范圍內(nèi),至少有6%的土地受到鹽分的影響,而濃度為50毫摩爾/升的鹽水,會(huì)使眾多水稻品種的產(chǎn)量減少一半。因此,努力提升水稻的耐鹽性,可有效增加邊際鹽堿土地的利用率,并提高作物的產(chǎn)量,這對(duì)保障糧食安全、增加土地產(chǎn)出和減少貧困都至關(guān)重要。
此前的調(diào)查研究結(jié)果表明,水稻在幼苗、生殖和2—3葉期最容易受到鹽脅迫的影響。鹽度的高低,會(huì)在滲透脅迫、離子毒性和氧化脅迫3個(gè)階段影響水稻生長(zhǎng)。在精英種質(zhì)資源中鑒定耐鹽數(shù)量性狀基因座或相關(guān)基因并將其應(yīng)用于培育新的耐鹽品種具有巨大的價(jià)值。
近年來(lái),由袁隆平院士領(lǐng)銜的青島海水稻研究發(fā)展中心致力于“海水稻”研發(fā),利用基因測(cè)序技術(shù),篩選出天然抗鹽、抗堿、抗病基因,通過(guò)常規(guī)育種、雜交與分子標(biāo)記輔助育種技術(shù),計(jì)劃在3年內(nèi)選育出可供產(chǎn)業(yè)化推廣、每畝單產(chǎn)300公斤以上的耐鹽水稻品種。目前發(fā)展中心已經(jīng)取得階段性成果,2016年試驗(yàn)種植中突破畝產(chǎn)500公斤,2017年在使用含鹽量0.6%咸水灌溉的實(shí)驗(yàn)田,小面積測(cè)產(chǎn)最高每畝單產(chǎn)達(dá)到621公斤。2018年篩選出176份優(yōu)良材料在全國(guó)5大典型鹽堿地試種。
51個(gè)基因座與鹽脅迫相關(guān)
水稻大都指淡水稻。海稻不是新品種而是與水稻、旱稻并列的稻類(lèi)。
1986年,我國(guó)農(nóng)業(yè)科研人員陳日勝在羅文烈教授帶領(lǐng)下,在廣東省湛江市普查紅樹(shù)林資源時(shí),在燕巢村海邊發(fā)現(xiàn)一株比人還高、看似蘆葦?shù)Y(jié)著穗的稻子。在羅文烈教授叮囑下,陳日勝收下522粒種子,通過(guò)30多年的繁育,將這種海水稻種子延續(xù)至今,并將其命名為“海稻86”。
在此期間,陳日勝等人曾對(duì)在正常和高鹽度條件下生長(zhǎng)的“海稻86”進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,并鑒定了大量鹽誘導(dǎo)的差異表達(dá)基因,他們將這些基因分為五肽重復(fù)序列家族、過(guò)氧化物酶基因、消化道基因、多抗菌擠壓蛋白家族基因、谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶基因?!巴ㄟ^(guò)在不同鹽濃度下生長(zhǎng)的‘海稻86’的各種性狀的全基因組相關(guān)分析,此前的研究發(fā)現(xiàn)了與鹽脅迫顯著相關(guān)的51個(gè)基因座?!眳卿h玲說(shuō)。
“海稻86”雖已被證明具有很強(qiáng)的耐鹽堿、耐淹和耐貧瘠土地生長(zhǎng)的能力,但人們對(duì)這種寶貴資源的認(rèn)識(shí)和研究還不足,對(duì)其耐鹽性機(jī)理也不清楚,更沒(méi)有數(shù)量性狀基因座圖譜或?qū)ζ淠望}性機(jī)理的分析報(bào)道。
分子標(biāo)記定位出與耐鹽性高度關(guān)聯(lián)的基因座
吳鋒玲和徐鵬研究員、余迪求研究員等人在此次最新研究中發(fā)現(xiàn),在鹽土環(huán)境條件下,耐鹽種質(zhì)資源“海稻86”在幼苗期就表現(xiàn)出比普通水稻品種更高的耐鹽性,遺傳分析結(jié)果顯示對(duì)鹽敏感為顯性。
他們利用“海稻86”為供體親本,云南粳型水稻品種“滇粳優(yōu)1號(hào)”為受體親本,構(gòu)建了F2群體并進(jìn)行分離群體分組分析法測(cè)序分析,在1號(hào)染色體上確定了一個(gè)2.78Mb的區(qū)域作為候選區(qū)域。為了進(jìn)一步縮小候選區(qū)域范圍,他們還利用分子標(biāo)記進(jìn)行數(shù)量性狀基因座定位,最終獲得了一個(gè)對(duì)表型貢獻(xiàn)率超過(guò)60%的主效數(shù)量性狀基因座,并將其命名為qST1.1。研究組進(jìn)一步培育片段替換系和滲入系,通過(guò)表型證實(shí)qST1.1確實(shí)與“海稻86”的耐鹽性有關(guān),而且具有較高的產(chǎn)量和品質(zhì)。
這一新發(fā)現(xiàn),為我國(guó)選擇耐鹽水稻品種提供了一種新的有效途徑,將有助于水稻耐鹽機(jī)理的解析和利用分子選育優(yōu)質(zhì)耐鹽水稻品種。相關(guān)研究結(jié)果近期發(fā)表在國(guó)際分子多樣性保護(hù)組織旗下的《農(nóng)藝學(xué)》期刊上。
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