最大規(guī)模國(guó)人基因庫(kù)問世
本報(bào)訊 (特約記者朱凡)近日,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院內(nèi)分泌科領(lǐng)銜中國(guó)代謝解析計(jì)劃(ChinaMAP)聯(lián)盟攜全國(guó)29家研究機(jī)構(gòu)和醫(yī)院,在《細(xì)胞研究》雜志首次報(bào)道了對(duì)27個(gè)省份、8個(gè)民族、超過1萬人的高深度全基因組測(cè)序數(shù)據(jù)和表型的系統(tǒng)性分析。這為疾病機(jī)制研究、預(yù)防、遺傳咨詢和公衛(wèi)管理提供依據(jù)。
據(jù)介紹,研究團(tuán)隊(duì)完成了中國(guó)人群遺傳變異數(shù)據(jù)構(gòu)建、中國(guó)人群體結(jié)構(gòu)分析、基因組特征比較以及變異頻譜和致病性變異解析。ChinaMAP一期數(shù)據(jù)庫(kù)包含1.36億個(gè)基因多態(tài)性位點(diǎn)SNP和1000萬個(gè)插入或缺失位點(diǎn)(NDEL),其中一半是國(guó)際通用的多個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中均沒有的新位點(diǎn)。
研究揭示,中國(guó)人群中先天性甲狀腺功能減低癥、慢性胰腺炎、遺傳性掌跖角化癥等疾病的致病基因變異攜帶者較歐美人群更多,且具有地域分布特征。研究組對(duì)中國(guó)人的營(yíng)養(yǎng)代謝和藥物代謝相關(guān)遺傳特征也進(jìn)行了分析比較。比如,酒精代謝能力,從總體上看,北方人比南方人酒量相對(duì)好,藏族、蒙古族、彝族人和河南人酒量居于全國(guó)前列,山東人酒量并不突出,福建人和廣東人排在最后。研究證實(shí),導(dǎo)致喝酒臉紅和酒精代謝能力差的乙醛脫氫酶2基因rs671變異是東亞人特異性的,在中國(guó)人群中的攜帶者遠(yuǎn)高于全球其他人群。rs671變異也是誘發(fā)食管癌發(fā)生的重要風(fēng)險(xiǎn)因素。
另外,研究團(tuán)隊(duì)也對(duì)抗凝藥華法林的減量使用、抗血小板藥物氯吡格雷的適用人群分類、他汀類降脂藥副作用風(fēng)險(xiǎn)人群進(jìn)行了分析。例如,對(duì)于高脂血癥常用的降脂藥辛伐他汀,中國(guó)人中有超過20%的個(gè)體存在橫紋肌溶解這一不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn),提示了針對(duì)我國(guó)人群特征的藥物基因組研究和藥物基因檢測(cè)的重要性。
研究還探索了肥胖遺傳因素。研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)了東亞人群新的特異性CADM2基因位點(diǎn),該位點(diǎn)在動(dòng)物研究中證實(shí)參與體重調(diào)節(jié)。而FTO等在歐美人群中發(fā)現(xiàn)的肥胖相關(guān)基因位點(diǎn),在中國(guó)人群中分布不顯著。
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